Научная библиотека была организована одновременно с университетом в 1922 году.

Первым ее директором была Е. Г. Мислер, собиравшая библиотеку в послевоенные годы. Огромный вклад в формирование научного фонда внесла В. Г. Барышева, ветеран ВОВ, руководившая библиотекой более 20 лет. С 1985 по 2018 годы научную библиотеку возглавляла Л. Г. Бутко.

С 2018 года библиотекой руководит Спасова Татьяна Георгиевна.

Фонд библиотеки сегодня – это 800 тыс. экземпляров научной, учебной, учебно-методической и справочной литературы. Ежегодно выписывается более 120 названий журналов: научных, научно-популярных, литературно-художественных.

Для студентов и сотрудников работают 3 читальных зала: универсальный, зал юридической литературы, зал для преподавателей и научных сотрудников, общий фонд которых составляет более 150 тысяч документов: энциклопедии, словари, справочники, труды Кубанского ГАУ и других вузов и научных учреждений.

В 1989 году из общего фонда книгохранения выделен фонд редкой книги – более 9239 изданий с 1779 г. Это словари Брокгауза и Ефрона, братьев Сабашниковых, братьев Гранат, Д. Сытина и др., краеведческая периодика с 1863 года.

С 1995 г. в библиотеке ведется компьютерная обработка новых поступлений, сформированы базы данных собственной генерации:

Библиотекой издаются рекомендательные тематические указатели, биобиблиографические указатели, путеводители по трудам университета, библиографический указатель диссертаций, защищенных в КСХИ-Кубанском ГАУ с 1955 года.