Кафедра информационных систем организована в 1980 году, выделившись из состава кафедры экономической кибернетики. Со дня ее организации кафедрой руководил Семенов Михаил Игнатьевич д.э.н., профессор, заслуженный деятель наук Кубани.

На сегодняшний день кафедрой руководит профессор д.э.н., к.ф.-м.н., профессор Попова Елена Витальевна.

Из состава кафедры выделены новые кафедры «Компьютерных технологий и систем», «Системного анализа и обработки информации», что явилось основой для организации в университете факультета Прикладной информатики.

Кафедра информационных систем руководит подготовкой обучающихся по следующим направлениям:

• 09.03.03 Прикладная информатика, направленность «Прикладная информатика в экономике» (программа прикладного бакалавриата);
• 09.03.03 Прикладная информатика, направленность «Менеджмент проектов в области информационных технологий, создание и поддержка информационных систем» (программа бакалавриата);
• 09.04.03 Прикладная информатика, направленность «Менеджмент проектов в области информационных систем» (программа магистратуры);
• 09.06.01 Информатика и вычислительная техника, направленность «Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ» (программа подготовки кадров высшей квалификации).

С 2007 года под руководством д.э.н., к.ф.-м.н., профессора Поповой Е.В. было защищено 5 диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, под руководством д.э.н., профессора Семенова М.И. - 2 диссертации.

В настоящее время на кафедре ведут подготовку научно-квалификационных работ 2 аспиранта.

Ведущая научная школа на кафедре информационных систем осуществляет свою работу по направлениям «Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ» и «Математические и инструментальные методы экономики».

Руководителем научной школы является профессор, д.э.н., к.ф.-м.н. Попова Е.В., заведующий кафедрой информационных систем.

Состав школы: к.э.н., доцент Бардин А.К., к.э.н., профессор Великанова Л.О., к.э.н., доцент Гайдук Н.В., к.э.н., доцент Замотайлова Д.А.,  к.э.н., доцент Кондратьев В.Ю.,  к.э.н., доцент Кумратова А.М., к.э.н. Курносова Н.С., к.э.н., доцент  Попок Л.Е., к.э.н., доцент Тюнин Е.Б., к.э.н., доцент Савинская Д.Н., к.т.н., доцент Петров А.А., к.т.н., доцент Рыбалкин И.П., аспиранты Коляда В.В., Грушко В.А., Лытнев Н.Н. 

Актуальность научной школы обусловлена тем, что вопросы математического моделирования, разработки и оптимизации численных методов и комплексов программ, а также применения математических методов в различных областях (в том числе, в экономике) в настоящее время активно изучаются, что, в сою очередь, позволяет на практике существенно оптимизировать их функционирование.

Одним из направлений исследований является разработка экономико-математических аппаратов и комплексных методик, базирующихся на оптимизации и адаптации существующих методов, моделей, методик и комплексов программ.

Целью исследований является повышение эффективности деятельности объектов исследования путем внедрения в их работу разработанных методов, методик, моделей и комплексов программ.

Новизна и значимость результатов заключается в разработке и применении методов, методик, моделей и комплексов программ для задач управления в различных сферах и на различных уровнях.

По результатам работы научной школы за последние три года подготовлено и опубликовано более 200 научных работ (в том числе, в журналах, рекомендованным ВАК РФ).

В рамках деятельности ведущей научной школы проводится Международный Форум «Информационное общество: современное состояние и перспективы развития» и Всероссийская научно-практическая конференция "Цифровизация экономики: направления, методы, инструменты", одной из основных задач которых является формирование навыков научно-исследовательской работы у обучающихся, апробация ими разработок, подготовка к научно-исследовательской деятельности на более высоких ступенях высшего образования.

Обучающиеся участвуют в подготовке научных работ для конкурсов различного уровня, представляют свои разработки в рамках конкурсов «IQ года» и «У. М. Н. И. К.», принимают участие в конференциях и форумах различного уровня.

В настоящий момент под руководством д.э.н., к.ф.-м.н., профессора Поповой Е.В. при поддержке РФФИ выполняется грант "Экономико-математическое моделирование туристической и рекреационной деятельности"; под руководством к.э.н., доцент Замотайловой Д.А. при поддержке РФФИ - грант "Развитие и адаптация математических и инструментальных методов прогнозирования и многокритериального и компромиссного анализа в социальных сферах"

Профессорско-преподавательский состав и обучающиеся участвуют в конкурсах различных уровней, направленных на получение грантов.